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人類腸道寄生許多細菌，不論好壞都有，好菌能夠幫助消化食物，幫助免疫系統強度，壞菌則容易致病，導致腹瀉或其他疾病，適當補充腸道好菌，可以減少腸道壞菌數量，維持腸子正常運作，促進身體健康，但免疫力不足患者，由於抵抗力不能壓制細菌作用，補充好菌也可能有致病風險。
腸道好菌可稱益生菌
書田診所小兒科主治醫師葉勝雄表示，腸道的好菌可稱為益生菌，種類與樣態非常多，大致尚可分為協助減少腹瀉與避免過敏，可是到目前預防過敏效用不明確，因此病患最好仍舊使用一般藥物，腹瀉患者使用益生菌，大約能夠減少腹瀉病程一天，因此部分患者腸胃疾病就診，醫師會開立藥用益生菌輔助治療。
好菌多壞菌就少
腸道益生菌與壞菌數量通常會維持平衡，益生菌數量較多，壞菌數量就比較少，但是現代社會飲食與作息常不規律，容易讓壞菌變多，讓益生菌變少，有引起疾病風險，適量補充益生菌，可以增加腸道好菌數量，降低壞菌影響；另外，部分患者因為服用抗生素，因腸道內好壞菌都會殺死，也可食用益生菌補充。
益生菌抗過敏仍須研究
葉勝雄補充，部分研究發現，益生菌可以降低過敏病兆，但並非所有實驗都有相同結果，因此不需要太依賴益生菌對抗過敏，可以先短期試試看，確認抗過敏益生菌對自己是否有效，若發現沒有明顯改善，就不用繼續服用，目前最有效的方法依舊是服用藥物，讓過敏機率症狀與風險降低，減少生活影響。
出國前先補充腸道益生菌
出國旅遊常會有水土不服，原因是當地細菌身體從未接觸，沒有對抗與保護能力，因此出國前可以先服用益生菌，讓腸道好菌增加，降低國外細菌影響力，也就能降低水土不服病徵；但免疫功能低下患者，因為抵抗力不能讓細菌維持在腸道，額外補充益生菌很可能讓細菌跑到血液中，讓菌血症發生機率增加。
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資料來源：台灣新生報